После установки обновлений для Visual Studio 2005, во время компиляции проекта может появиться сообщение «Unable to find manifest signing certificate in the certificate store». Если такое случилось, то ... без паники, с проектом все нормально J.
Просто надо открыть свойства проекта, стать на Signing и отключить «Sign the ClickOnce manifest». Сохранить свойства.